液相色谱流动相过滤的主要原因是为了去除流动相中的颗粒物、微生物和其他杂质，以确保液相色谱系统的正常运行和分析结果的准确性。

流动相中的颗粒物和微生物可能会堵塞液相色谱系统的管道、色谱柱和检测器等部件，导致液相色谱系统无法正常运行，甚至损坏仪器。此外，流动相中的杂质也可能会影响分析结果的准确性，降低分析的可靠性和重现性。

通过过滤，可以去除流动相中的颗粒物和微生物，从而避免这些问题的发生。过滤还可以减少流动相中的杂质，从而提高分析结果的准确性和重现性。

需要注意的是，过滤并不能完全去除流动相中的所有杂质。因此，在使用液相色谱系统时，还需要对流动相进行其他处理，如脱气、除湿等，以进一步提高流动相的质量和分析结果的准确性。