制备色谱柱金属残留量较低低，使得键合率增加，游离的硅羟基减少，假如还要更保险，从活动相开端进入体系内部的时分，就要留意杂质的去除，更多时分，总是会呈现一些”奇奇怪怪”的峰型，比方峰拖尾、峰前延、倒峰、宽峰等。

它是中草药中最重要也最具有价值的生物活性成分之一，生物碱可分为59种，它们的结构比较复杂，用传统的方法分离效果不佳，高效液相色谱法还没呈现之前，关于生物碱的分离纯化一直是学者们的难题，可是，即便使用液相色谱法分离。

也会存在许多问题，碱性化合物剖析中最显著的难题是峰形拖尾，而且碱性越强的时分，为什么会呈现这样的情况呢？要针对不同的峰型来具体剖析，调节活动相也能够改善峰拖尾的现象，前期在挑选活动相的时分，要考虑活动相pH值的范围，对碱性化合物来说，活动相的pH值对峰形会有较大影响，而且对保留因子和挑选性也有很大影响，在设定挑选样品剖析的HPLC方法时，首先需求依据化合物的分子量巨细，极性巨细等因素挑选适宜的分离形式，在适当的分离形式下去挑选适宜的色谱柱及活动相。